Не будучи поклонником городской жизни, Сетон-Томпсон подолгу жил в лесах и прериях. Он написал около 40 книг, главным образом о животных. Повествование в своих книгах он сопровождал точными и искусно выполненными рисунками. Первое произведение - "Жизнь лугового тетерева" (1883). Известность писателю принесли книги "Дикие животные, как я их знаю" (1898), "Жизнь тех, на кого охотятся" (1901), а также 8-томный труд "Жизнь диких зверей" (1925-1927). В его книгах научная точность сочетается с занимательностью изложения. Эрнест Сетон-Томпсон оказал влияние на многих писателей-анималистов.